Руководство:

- Рыскулов Уланбек Дуулатович — председатель Государственного комитета промышленности, энергетики и недропользования Кыргызской Республики

- Асанов Айбек Кадырович — статс-секретарь Государственного комитета промышленности, энергетики и недропользования Кыргызской Республики

- Аликеев Суйунтбек Сакыевич — заместитель председателя Государственного комитета промышленности, энергетики и недропользования Кыргызской Республики

- Сапаралиев Азис Айнабаевич — заместитель председателя Государственного комитета промышленности, энергетики и недропользования Кыргызской Республики

- Мырзаканов Кубан Нуржанович — заместитель председателя Государственного комитета промышленности, энергетики и недропользования Кыргызской Республики

Оморов Азамат Каныбекович — заместитель председателя Государственного комитета промышленности, энергетики и недропользования Кыргызской Республики

Центральный Аппарат ГКПЭН КР

Управление геологии — начальник Сатыбеков Мелис Бакытович,

Управление охраны недр — начальник Дюшеев Алтынбек Мамбеткулович,

Управление регулирования промышленной безопасностью — Гильфанов Ильдар Вазифович,

Управление лицензирования недропользования — начальник Курумшиев
Руслан Джекшенбекович,

Управление политики по недропользованию — Абылаев Тимур Замирбекович,

Управление правового обеспечения — Муканов Элдияр Табылдиевич,

Управление машиностроения, металлургии и стройматериалов — Термечикова Гулнара Кубанычбековна,

Управление электроэнергетики — Чолпонкулов Маратбек Абжалбекович,

Подведомственные предприятия ГКПЭН КР:

ГП Северо-Кыргызская геологическая экспедиция — директор Исмаилов Токтоназар Корчубекович,

ГП Южно-Кыргызская геологическая экспедиция — директор Нурбаев Абдыманап Омурзакович,

ГП Кыргызская комплексная гидрогеологическая экспедиция — директор Мусуралиев Камчибек,

ГП Кыргызская методическая экспедиция геолого-экономических исследований — директор Кожогулов Бакытбек Камчибекович,

ГП Кыргызская геофизическая экспедиция — Халилов Зайлабидин Халилович,

ГП Бишкекский опытно-экспериментальной завод горноразведочной техники — Директор Бабаев Марип Бабаевич

ГП Центральная лаборатория — директор Айтбаев Джиргалбек Валиевич,

ГП «КЫРГЫЗКӨМҮР» — директор Джаманбаев Мырза Кермалиевич.

Примечание: Госкомитет ранее был Госагентством по геологии и минеральным ресурсам.

По состоянию на 4 апреля 2016 года в состав руководства Государственного агентства по геологии и минеральным ресурсам входят:

Руководство:

- директор агентства — Дуйшенбек Зилалиев Текшербекович,

- заместитель директора агентства — Рыскулов Уланбек Дуулатович.

Подведомственные организации Госгеологии:

- директор ГП «Северо-Кыргызская геологическая экспедиция» — Исмаилов Токтоназар Корчубекович,

- директор ГП «Южно-Кыргызская геологическая экспедиция» — Нурбаев Абдыманап Омурзакович,

- директор ГП «Кыргызская комплексная гидрогеологическая экспедиция» — Мусуралиев Камчибек,

- директор ГП «Кыргызская методическая экспедиция геолого-экономических исследований» — Тынаев Бекташ Дуйшембиевич,

- директор ГП «Центральная лаборатория» — Айтбаев Джиргалбек Валиевич,

- директор Государственной картографо-геодезической службы — Катанаев Анатолий Георгиевич.

Аппарат:

- Черикчиев Марс Маликович — советник директора,

- Байышбек уулу Акимбек — помощник директора,

- Ивченко Анна Алексеевна — заведующая первым сектором,

- Эшназаров Наби Асанович — начальник управления геологии,

- Сапаралиев Азис Айнабаевич — начальник управления информационных ресурсов,

- Курумшиев Руслан Джекшенбекович — начальник управления лицензирования недропользования,

- Сатыбалдиев Нарынбек Мадыярович — начальник управления охраны недр и горнодобывающей промышленности,

- Гильфанов Ильдар Вазифович — начальник управления регулирования промышленной безопасности,

- Асанов Айбек Кадырович — заведующим отделом правового обеспечения,

- Тюменбаева Диляра Эмильевна — заведующая отделом инвестиций и внешних связей,

- Турдуманбетова Айна Долотбековна — начальник управления финансов и экономики,

- Ямалтдинова Муслима Хасановна — заведующая отделом экономики и анализа,

- Джолдошева Назира Асылбековна — заведующая сектором по управлению человеческими ресурсами,

- Мамырова Гулжан Окомбаевна — заведующая сектором делопроизводства,

- Албанов Нурбек Калыкович — заведующий сектором информационного обеспечения.

По состоянию на 7 апреля 2014 года в состав руководства входят:

Зилалиев Дуйшенбек Текшербекович — директор Государственного агентства по геологии и минеральным ресурсам

Султанов Шерикул Жорупбекович — статс-секретарь Государственного агентства по геологии и минеральным ресурсам

Рыскулов Уланбек Дуулатович — заместитель директора Государственного агентства по геологии и минеральным ресурсам

Подведомственные организации Госгеологии

Северо-кыргызская геологическая экспедиция

Алымкулов Болоткан Исмаилович — начальник

Южно-кыргызская геологическая экспедиция

Дыйканбаев Куванычбек Абдыжапарович — начальник

Кыргызская комплексная гидрогеологическая экспедиция

Мусуралиев Камчибек — начальник экспедиции

Кыргызская методическая экспедиция геолого-экономических исследований

Тынаев Бекташ Дуйшембиевич — начальник

Кыргызская геофизическая экспедиция

Халилов Зайлабидин Халилович — начальник

Алайская геофизическая партия

Акматов Акылбек Мамажанович — начальник

Бишкекский опытно-экспериментальный завод горноразведочной техники

Бабаев Марип Бабаевич — директор

Домоуправление геологии

Султаналиев Эркин Сейтканович — управляющий

Межотраслевой учебный центр

Аликеев Суйунтбек Сакыевич — директор

Государственная картографо-геодезическая служба

Катанаев Анатолий Георгиевич — директор

Центральная лаборатория

Айтбаев Джиргалбек Валиевич — начальник ЦЛ

Пресс-служба Министерства природных ресурсов КР предоставила список руководителей ведомства по данным на 25 июля 2011 года:

Министр природных ресурсов — Эсенаманов Замирбек Садыбакасович

Заместитель министра природных ресурсов — Оселедько Леонид Анатольевич

Статс-секретарь — Эшназаров Наби Асанович

Начальник управления геологии и информационных ресурсов — Суванкулов Руслан Совитович

Начальник управления геоэкологии — Шабаева Гульфия Рашитовна

Начальник управления правового обеспечения и международного сотрудничества — Сейдалиев Болот Акбергенович

Начальник управления анализа природопользования — Тулеев Тамчыбек Карыбекович

Начальник управления экономики и финансов — Ямалтдинова Муслима Хасановна

Начальник управления административной поддержки — Касымбеков Омурбек Искакович

Начальник управления лицензирования недропользования — Коноков Каныбек

Начальник отдела нормативного обеспечения и государственного экологического контроля управления геоэкологии — Сапаралиев Азис Айнабаевич

Заведующая сектором делопроизводства — Мамырова Гулжан Окомбаевна

Начальник отдела по привлечению инвестиций и международного сотрудничества — Шамеев Азамат Султанович

В настоящее время вакантны должности начальника управления регулирования прав пользования недрами и начальника управления охраны недр и горнодобывающей промышленности.